مرکز آموزش مجازی در ابتدای امر با عنوان واحد آموزش مجازی در اواسط سال 1396 در مرکز مطالعات و توسعه علوم پزشکی EDC دانشگاه علوم پزشکی قم تاسیس شد و رفته رفته با جذب نیروهای متعهد و متخصص به سمت تکنولوژی های آموزشی سوق داده شد و با شیوع ویروس فراگیر کرونا و فراگیری اموزش مجازی در دانشگاه های سرار کشور تمامی دانشگاه ها نیاز و کمبود اموزش مجازی را در دانشگاه ها  حس کردند که خوشبختانه این دانشگاه به سرعت منطبق با نیاز های دانشجویان و عدم توقف در امر یادگیری سریعا با اختصاص چارت سازمانی مستقل با عنوان مرکز آموزش مجازی دانشگاه علوم پزشکی قم توانست ، رسالت توسعه علوم پزشکی و توانمند سازی اساتید در تولید محتوا و همچنین استفاده از تکنولوژی های اموزشی در جهت برگزاری کلاس ها و آزمون های دانشجویان گام مهمی بردارد و  این امر همچنان ادامه دارد و در حال تکمیل پرسنل مجرب و تخصیص فضای های حرفه ایی تولید محتوا و حتی تجهیز فضای کار مناسب برای این مرکز می باشد . این مرکز در حال حاضر دارای مرکز تخصصی آزمون با 100میز فعال و اتاق اکوستیک جهت تولید محتوای الکترونیکی می باشد .